過去大戰(zhàn)時期,日本帝國陸軍為將咒術(shù)運用在軍事上而建立陰陽寮,并派任傳說中陰陽師安倍晴明的后裔、土御門家當家的天才陰陽師土御門夜光擔任統(tǒng)領(lǐng),成功締造日本咒術(shù)界的改革,成為現(xiàn)代咒術(shù)之父。大戰(zhàn)末期,處于敗勢的帝國陸軍要求夜光實行大規(guī)模咒術(shù)儀式以挽回局勢,但結(jié)果儀式失敗,不僅做為執(zhí)行者的夜光身亡,還強烈地擾亂首都東京的靈氣,使東京百鬼夜行、妖魅縱橫。直到了戰(zhàn)后陰陽寮改名陰陽廳,負責處理日本各地-主要是東京-發(fā)生的靈力災(zāi)害,而陰陽師也因而活躍在現(xiàn)代的舞臺之上。土御門春虎是個出生土御門家的少年,雖身為陰陽師名門后代,卻毫無陰陽師才能,過著一般人的生活。某年夏天,春虎遇見了他的童年玩伴,也是土御門家的下任當家的少女夏目。過去曾允下承諾如今卻分道而行的兩人,在此刻相見之后,土御門的歷史開始轉(zhuǎn)動了起來......